某种情况来说，尼尔世界的人类，其实在外星生命体入侵地球之前，就已经全部灭绝了。
其灭绝的主要原因，还要从尼尔机械纪元的前作，以及关联作品说起。
尼尔世界的诞生，源自于游戏《龙背上的骑兵》的其中一个结局。
身处在另一个异世界的，名为凯姆地少年与他的红龙伙伴，在最终决战之前，被传送门传送走，离开了异世界，并掉到了接近万年前的，尼尔机械纪元所在的地球。
名为凯姆地少年与他的红龙伙伴安吉尔所出现的地点，便是在东京的新宿地区。
在那里，他们与突然出现的白色巨人战斗后，艰难取胜后。
但因为人类不知道他和她的红龙伙伴是敌是友的情况下，选择了对他们展开攻击。
在两发导弹的攻击下，凯姆和安吉尔被双双击杀，红龙安吉尔的尸体也就此被人类缴获，运走。
但这也为人类的灭亡埋下了伏笔。
红龙体内存在病毒微粒，也被称为魔素的东西开始扩散，并逐渐演化出了一种席卷全球的绝症，‘白盐化症候群’。
感染这种病毒的人类，绝大部分会逐渐结晶盐化，并最终死亡，少部分则是会发狂，并彻底化作魔物！
面对这种可怕的绝症，人类经过研究也最终束手无策。
在危急存亡之际，人类选择了启动了所谓的格式塔计划。
格式塔计划，就是将全球所有人的灵魂和肉体分离后，储存在一个名为格式塔的网络中。
并制造了新的人造人躯体后，伴随着人造人年龄的增长，当肉体和灵魂的年龄吻合时，再将灵魂取出，放到人造人的身躯中，让人类脱离绝症的困扰，重新繁衍生息。
而格式塔计划，最终也落在了一个名为尼尔的少年身上。
尼尔天生具有着十分强大的魔素适应性，在研究人员眼中，他是一个十分合适的，维持格式塔运转的实验体。
而因为尼尔的妹妹悠那患有绝症，所以，研究人员以答应尼尔冷冻其妹妹千年的条件，让尼尔资源成为了维持格式塔计划的核心。
不过，他们并没有履行诺言，而是在尼尔被抽离灵魂，成为格式塔计划核心后，也见过悠那的灵魂抽离，放入格式塔内后，并制造了悠那的人造人。
虽然从另一种层面上来讲，只要格式塔计划成功，尼尔的妹妹依旧可以重新复活吧。
但凡事总有意外。
尼尔作为格式塔计划的核心，维持着全球数十亿人灵魂的运转。
而作为后手，人类制造了双子人造人，即迪瓦拉和波波拉。
她们作为尼尔人造人躯体的引导者，一直照顾着尼尔人造人躯体的存活。
因为格式塔计划需要让所有人类的人造人躯体，全部重新生长到被抽离灵魂时，所有年龄的程度，导致这本就是一个十分漫长的过程。
（其实就是人类被抽灵魂时年龄不一样，制造的人造人身躯却是从一岁开始成长的，为了让所有的人类灵魂都有匹配的人造人躯体，就需要不断地让人造人身躯轮回，直到所有人造人的躯体，都和本体灵魂的年龄吻合，才能够释放格式塔的所有灵魂）
（而且虽然都叫人造人，但人工生命里的是真正的肉体，而机械纪元的就是纯机械了，两者有差别）
但在漫长的相处中，波波拉和迪瓦拉，对人造人状态的尼尔产生了额外的亲情，导致她们已在推后即将到来的，解放格式塔的契机直到……
一种名为黑文病的绝症，开始在人造人群体中肆虐开来。
这是一种预兆，预兆着格式塔计划的维持着，真正的尼尔已经快要坚持不住了。
而问题也在于，人造人尼尔的妹妹，人造人悠那，也感染了黑文病！
为了解救妹妹，人造人尼尔也踏上了寻找解除黑文病的旅途。
至于接下来的结果就显而易见了。
为了拯救自己的妹妹，人造人尼尔，在历经磨难后，知晓格式塔计划的所有真相，并在面对本体尼尔化作的魔王时，将本体尼尔击杀了……
作为维持格式塔计划的载体，尼尔的死亡导致格式塔计划直接崩毁，里面维持着的全人类的灵魂也随之彻底消亡！
至此，尼尔机械纪元的人类文明彻底完蛋。
当最后一个拥有肉体的人造人死亡，尼尔世界的人类，就此彻底消失。
剩下的，就是以机械状态为主的，人造人还存活在地球之上。
至于再后来的事情就很简单了，外星生命体入侵地球，人造人举着人类的大旗开始反抗，与外星生命体制造的机械生命体展开了旷日已久的战争。
直到外星生命体被反噬杀死，战争却依然没有停止。
姬浩负手而立，看着远处那蔚蓝色的地球，也是缓缓开口道。
“无论人类是否存在，这颗星球依旧是这般模