兵变发生后，陈炯明在惠州发表通电，声称兵变是叶举等人的擅自行动，与自己无关，并表示愿意与孙中山进行和平谈判，解决分歧。但孙中山在永丰舰上发表通电，指责陈炯明“叛国作乱”，号召各地革命党人讨伐陈炯明。
关于六一六兵变的真相，史学界至今仍有诸多争议：
- 争议一：陈炯明是否下令兵变？ 支持陈炯明的史料认为，陈炯明在兵变前曾多次劝阻叶举等人不要采取极端手段，兵变是叶举等人擅自发动的；反对陈炯明的史料则认为，陈炯明是兵变的幕后主使，叶举等人只是执行者。- 争议二：兵变的目的是“驱孙”还是“杀孙”？ 从兵变的过程来看，粤军并未全力追杀孙中山，而是给了孙中山逃离的时间。叶举等人后来也表示，兵变的目的是“驱孙”，而不是“杀孙”，是为了逼迫孙中山停止北伐，恢复陈炯明的职务。- 争议三：兵变的性质是“叛乱”还是“政见之争”？ 传统史观认为，兵变是陈炯明背叛孙中山的“叛乱”行为；现代史观则认为，兵变是孙陈政见分歧激化的结果，是一场“政见之争”，而非“个人叛乱”。
无论真相如何，六一六兵变的爆发，彻底撕裂了孙中山与陈炯明的关系，也让革命阵营陷入了严重的分裂。兵变不仅导致北伐战争的中断，也让陈炯明的政治生涯跌入谷底，他从此被贴上了“叛徒”的标签，背负了百年的骂名。
6.3 永丰舰之困：孙中山的反击与陈炯明的妥协
兵变发生后，孙中山在永丰舰上坚守了五十六天，指挥海军与粤军对抗。他多次致电各地的革命党人与军阀，请求他们出兵援救，但响应者寥寥无几。此时的中国，军阀割据，各自为政，没有人愿意为了孙中山而得罪陈炯明。
陈炯明在惠州得知孙中山在永丰舰上坚守后，多次派人前往永丰舰，与孙中山进行和平谈判。他表示，愿意恢复孙中山的总统职务，停止兵变，条件是孙中山放弃北伐，支持联省自治。但孙中山坚决拒绝，要求陈炯明“下野谢罪”，否则绝不谈判。
谈判破裂后，陈炯明下令粤军封锁珠江口，围困永丰舰，试图逼迫孙中山投降。永丰舰的处境日益艰难，粮食与淡水短缺，士兵伤亡惨重。1922年8月9日，孙中山得知北伐军在江西战败的消息后，意识到坚守永丰舰已无意义，于是乘坐英国军舰离开广州，前往上海。
孙中山离开广州后，陈炯明重返广州，重新执掌广东的军政大权。他并未趁机称帝或独裁，而是继续推行联省自治政策，召开广东省议会，审议《广东省宪法草案》，试图将广东打造成联省自治的样板。但此时的陈炯明，已经被贴上了“叛徒”的标签，失去了全国人民的支持，他的联省自治理想，也开始走向破灭。
本小节结语
1922年的六一六兵变，是陈炯明一生的转折点，也是中国近代史上的一个重要事件。这场兵变，本质上是联省自治与武力统一两种治国理念的激烈碰撞，而非简单的个人背叛。兵变的爆发，让陈炯明身败名裂，也让孙中山的北伐计划受挫。但这场兵变也让中国的革命者意识到，单纯的武力革命无法解决中国的问题，必须寻找新的革命道路——这也为孙中山后来提出“联俄、联共、扶助农工”三大政策，与中国共产党合作，埋下了伏笔。
第七部分 兵败流亡：理想坚守与晚节自守（1922-1933）
7.1 粤军分裂：东江苦战与救粤军的覆灭
孙中山离开广州后，并未放弃讨伐陈炯明的计划。1923年1月，孙中山联络滇军将领杨希闵、桂军将领刘震寰，组成“西路讨贼军”，从广西进攻广东；同时，他任命许崇智为东路讨贼军总司令，率领粤军旧部从福建进攻广东，形成了东西两路夹击陈炯明的局面。
此时的粤军，已经陷入严重的分裂。一部分粤军将领投靠了孙中山，成为讨贼军的主力；另一部分将领则坚守东江，支持陈炯明。陈炯明率领残余的粤军，在东江地区与讨贼军展开了艰苦的战斗，史称“东江战役”。
东江战役持续了一年多的时间，陈炯明的粤军虽然作战勇猛，但因寡不敌众、粮草短缺，节节败退。1923年1月，西路讨贼军攻克广州，陈炯明被迫率领粤军退守东江的惠州、海丰、陆丰一带。1924年，孙中山在广州改组国民党，成立黄埔军校，组建国民革命军，增强了讨贼军的战斗力。1925年2月，国民革命军发动第一次东征，进攻陈炯明的粤军。
在第一次东征中，黄埔军校的学生军表现出色，连克淡水、惠州等重镇。陈炯明的粤军伤亡惨重，被迫退守海丰、陆丰。1925年10月，国民革命军发动第二次东征，彻底击败了陈炯明的粤军。陈炯明的根据地海丰、陆丰被攻克，他的残部要么投降，要么溃散。至此，陈炯明的军事力量彻底覆灭，他再也没有机会重返广东的政治舞台。
7.2 流亡香港：清贫自守与拒绝拉拢
1925年10月，陈炯明兵败后，被迫逃离东江，前往香港，开始了他的第二次